Pilot kamikaze staje w obliczu nowego zagrożenia na wyspie Ōdo. Ogromny potwór atakuje, zabijając inżynierów samolotów wojennych. Mężczyzna przytłoczony poczuciem winy z powodu tego, że nie udało mu się odciągnąć stworzenia i napędzany pragnieniem osobistego odkupienia, łączy siły z weteranami, aby stawić czoła potężnemu potworowi, znanemu jako Godzilla.

Rok 1945, końcówka II wojny światowej. Pilot kamikadze, Kōichi Shikishima (Ryunosuke Kamiki) ląduje w japońskiej bazie na wyspie Odo, twierdząc, że zmusiła go do tego awaria samolotu. Tymczasem mechanik Tachibana (Munetaka Aoki) wnioskuje, że chłopak tylko udaje, aby uciec od swoich obowiązków. Kiedy na atol napada Godzilla, Shikishima dostaje rozkaz zestrzelenia potwora. Mężczyzna ignoruje polecenie, wskutek czego załoga zostaje zabita, a z życiem uchodzi tylko on sam, oraz wspomniany mechanik.
Rok później, w roku 1946, Kōichi powraca do rodzinnego domu i dowiaduje się, iż jego rodzice zginęli podczas bombardowania Tokio. Przypadek sprawia, iż chłopak zapoznaje się z Noriko (Minami Hamabe) - dziewczyną, której rodzice również nie żyją. Dręczony wyrzutami sumienia pilot pomaga dziewczynie przygarniając ją pod swój dach. Niebawem miasto zostaje zaatakowane przez Godzillę, który niszczy wszystko na swojej drodze. W maju 1947 roku chłopak z dzielną załoga trałowca, rozpoczyna walkę o przetrwanie i powstrzymanie monstrum.